Для начала, у вас должна быть включена обработка товаров в настройках плана импорта.
Затем, в настройках сопоставлений, создаете новое сопоставление, сущность можете указать любую т.к. значение будет переписано, и указываете Поле товара "Включен ли НДС в цену".

Далее, создаете и привязываете к созданному сопоставлению следующую обработку:

Потом создаете новое сопоставление и указываете Поле товара "Код НДС":

Переходите в список ставок и запоминаете ID нужной ставки:

И создаете для сопоставления необходимую обработку:
